昭和9年、かつて南大東島では旧日本軍によって海軍飛行場が整備されていました。昭和38年から43年にかけて滑走路などが整備され、1,200m滑走路で運用。昭和47年の本土復帰を受け、49年には滑走路を800mへ縮小運用がなされました。那覇間とのアクセス時、悪天候などの影響を受けやすかった飛行場はその後移転され、平成9年に現在の新空港として滑走路1,500mで運用開始。現在はJALグループの「琉球エアーコミューター」により、那覇および北大東との定期便が就航。船とともに島民にとって重要な観光物流拠点となっています。アーチ状の外観が目を引く空港で、入口にあるモニュメントは「南大東村」との交流を象徴しています。

北大東空港は昭和46年に緊急着陸飛行場として建設されました。昭和53年に滑走路800ｍを有する空港として供用が開始。当初から那覇へ就航していたものの、悪天候や風に影響を受けやすく欠航が多いことが課題に挙げられていました。その後問題解決のため拡張整備を行い、平成9年には機材大型化に対応できる空港として1,500m滑走路で供用開始。現在はRAC（琉球エアーコミューター）によって南大東・那覇空港への定期便が就航しています。南大東空港との直線距離は約12kmで所要時間は15分ほど。定期航空路線としては日本で最も短い航路です。また、RACが就航する空港としては最東端に位置しており、島民にとって重要な拠点空港です。